O Campeonato Goiano de 2009 será disputados por 12 clubes, divididos em dois grupos (A e B).

Na primeira fase, as equipes do Grupo A enfrentam as do Grupo B em turno e returno e, depois, se enfrentam dentro dos próprios grupos, em turno único.

Depois dos três turnos, os dois primeiros colocados em número de pontos ganhos de cada grupo avançam para a semifinal, enquanto os dois últimos colocados por pontos ganhos na fase independentemente de grupo serão rebaixados.

As fases semifinal e final serão disputados em jogos mata-mata, ida e volta. Em caso de empate no saldo de gol dos dois duelos a decisão vai para os pênaltis.