Entenda o regulamento do campeonato:
O Campeonato Baiano de 2006 será disputado por 12 equipes. Os clubes estarão divididos em duas chaves. Bahia, Camaçari, Catuense, Colo-Colo, Fluminense e Poções formam o Grupo 1, enquanto Vitória, Juazeiro, Itabuna, Ipitanga Atlético e Camaçariense estão no Grupo 2.
No primeiro turno, as equipes do Grupo 1 enfrentam as equipes do Grupo 2 em turno e returno. Avançam paras as quartas-de-final os quatro primeiros colocados de cada chave. A partir de então, os jogos serão disputados no sistema mata-mata.
O campeão do primeiro turno está classificado para a decisão do campeonato, além de assegurar uma vaga na Copa do Brasil de 2007.
No segundo turno, as equipes se enfrentam dentro do próprio grupo até que sejam conhecidos os classificados para as quartas-de-final.
O vencedor do segundo turno enfrentará o campeão do primeiro turno pelo título de campeão baiano de 2006.