A Copa Sul-Americana será disputada em cinco etapas, com partidas de ida e volta, e cujo desenvolvimento responderá ao programa aprovado pelo Comitê Executivo e que forma parte deste regulamento.
A primeira fase será uma instância preliminar, composta por seis zonas. Serão disputadas partidas de ida e volta para determinar os classificados para a etapa seguinte. As zonas preliminares serão formadas da seguinte forma:
Preliminar Argentina:
Boca Juniors, River Plate, Estudientes de La Plata, San Lorenzo, Arsenal e Lanús.
Preliminar Brasil:
São Paulo, Vasco da Gama, Figueirense, Goiás, Corinthians, Cruzeiro, Botafogo e Atlético-PR.
Grupo A - Chile/Bolívia:
Colo Colo e Audax Italiano (Chile); Jorge Wilstermann e Real Potosí (Bolívia).
Grupo B - Equado/Venezuela:
El Nacional e Olmedo (Equador); Zamora e Carabobo (Venezuela).
Grupo C - Colômbia/Peru:
Atlético Nacional e Millionários (Colômbia); Coronel Bolognesi e Universitário (Peru).
GrupoD - Uruguai/Paraguai:
Danubio e Defensor Sporting (Uruguai); Libertad e Tacuary (Paraguai).
Na zona preliminar da Argentina, Arsenal x San Lorenzo e Lanús x Estudientes jogarão partidas de ida e volta entre si, cujos vencedores serão denominados ARG I e ARG IV, respectivamente. Boca Juniors e River Plate passarão diretamente às oitavas-de-final, como ARG III e ARG II, respectivamente.
Na zona preliminar do Brasil, Atlético-PR x Vasco, Figueirense x São Paulo, Botafogo x Corinthians e Goiás x Cruzeiro jogarão partidas de ida e volta entre si. Seguindo a ordem dos confrontos acima, as quatro equipes vencedoras estarão classificadas às oitavas-de-final e se denominarão BRA I, BRA II, BRA III e BRA IV, respectivamente.
Nos demais grupos da primeira fase, onde participam equipes de dois países diferentes, se disputará enfrentando-se os primeiros classificados de um país contra os segundos classificados do outro. Os ganhadores destes duelos se enfrentarão entre si para determinar os classificados às oitavas-de-final.
De cada um dos grupos da primeira fase surgirá um classificado para as oitavas-de-final, com exceção da zona preliminar de Argentina e Brasil, países que terão quatro representantes cada. Também se classificará diretamente às oitavas o campeão da edição anterior (Pachuca) e mais três times da Concacaf (Chivas Guadalajara, América e DC United).
As oitavas-de-final serão disputadas no mesmo sistema, partidas de ida e volta, assim como as fases seguintes, incluindo a final.
Sistema de definição em casos de empate
Em qualquer etapa da competição, em casos em que exista igualdade de pontos, estará classificada a equipe com melhor saldo de gols.
Caso ao término da segunda partida haja igualdade em pontos e saldo de gols, será declarado vencedor o time que tiver feito o maior número de gols fora de casa. Se a igualdade persistir, haverá disputa por pênaltis, conforme as normas da Fifa. Este critério será para todas as etapas do torneio.