O Grêmio Barueri foi fundado em Barueri, em 26 de março de 1989. Em 2001 passou a disputar campeonatos profissionais de futebol. A partir de 2002, a equipe ascendeu de divisão no Campeonato Paulista todos os anos, chegando à elite do Estado em 2006. No mesmo ano, a equipe disputou a Série C do Brasileiro e subiu à Série B, somando seis acessos em seis anos de time profissional. A estreia na Série A nacional foi em 2009, já conquistando vaga à Copa Sul-Americana. Em 2010, desavenças entre a prefeitura de Barueri e o clube fizeram com que o time se mudasse para Presidente Prudente, adotando o novo nome: Grêmio Prudente. No dia 11 de maio de 2011, para a surpresa de todos, o clube foi vendido para um grupo de empresários de Barueri, iniciando o processo de retorno à antiga sede e com isso retornando seu nome para Grêmio Barueri Futebol Ltda.

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